Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζουν οι εκκλησίες της Στεμνίτσας, από τις οποίες παλαιότερη είναι η Ζωοδόχος Πηγή ή Χρυσοπηγή, πρώην μοναστήρι που, κατά την παράδοση, κτίστηκε δέκα χρόνια πριν την Άλωση της Κωνσταντινούπολης (1453) και είναι κατάγραφο με τοιχογραφίες του 17ου αιώνα. Υπάρχει επίσης μια σειρά μικρών μεταβυζαντινών ναών, επίσης διακοσμημένων με τοιχογραφίες: O ναός του Αγίου Nικολάου στο παλαιό κοιμητήριο, «στο Kάστρο», όπου σώζονται σπαράγματα από τις παλαιότερες τοιχογραφίες της Στεμνίτσας (1589)· η Παναγία η Mπαφέρω στον ίδιο χώρο, κτισμένη το 17ο αιώνα, με τοιχογράφηση της ίδιας περιόδου· ο Προφήτης Hλίας «στο Kάστρο» και ο Άγιος Παντελεήμων στην άκρη του χωριού, στο δρόμο για τη Δημητσάνα, ναοί κτισμένοι στα μέσα του 17ου αι. και οι δύο τοιχογραφημένοι την ίδια περίοδο· ο Άγιος Γεώργιος ο «Kαταγιώργης», κτισμένος στη ρεματιά, με λαϊκότροπες τοιχογραφίες· ο ναός των Tριών Iεραρχών (ή Αγίων Αναργύρων) που κτίστηκε το 1715 και διακοσμήθηκε την ίδια εποχή από τον κρητικής καταγωγής αγιογράφο Πέτρο Πεδιώτη, ο οποίος είχε ζωγραφίσει μαζί με τον αδελφό του πολλές εκκλησίες στην ευρύτερη περιοχή. Τελευταίος χρονολογικά από τους ναούς της Τουρκοκρατίας είναι ο μεγάλων διαστάσεων ναός του Αγίου Γεωργίου στην πλατεία του χωριού, ο οποίος κτίστηκε στα 1810 στη θέση παλαιότερης εκκλησίας. Μετά την ίδρυση του ελληνικού κράτους και ιδιαίτερα στο δεύτερο μισό του 19ου αιώνα, περίοδο νέας ακμής για τη Στεμνίτσα, κατά την οποία κτίστηκαν τα περισσότερα από τα σημερινά σπίτια του οικισμού, ανεγέρθηκαν τέσσερις μεγάλες εκκλησίες με τρούλο, αντικαθιστώντας ομώνυμους μικρότερους μεταβυζαντινούς ναούς: ο ναός της Παναγίας, ο επονομαζόμενος «Καθολικό», ο οποίος δεν υπάρχει πια, ο ναός της Παναγίας της Καρυάς, ο ναός της Αγίας Παρασκευής και ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Προδρόμου στη ΒΔ Στεμνίτσα. Την ίδια εποχή κτίστηκε επίσης στη θέση παλαιότερου παρεκκλησίου, η εκκλησία του Αγίου Νικολάου στη θέση Αναφυτρός στη βόρεια πλευρά της Στεμνίτσας. Γύρω από την κωμόπολη, κυρίως στις κορυφές των λόφων υπάρχουν επίσης πολλά μικρά εξωκλήσια, που λέγεται ότι έγιναν στη θέση παλαιότερων, όπως οι Άγιοι Θεόδωροι, ο Άγιος Νικόλαος στο Αεράκι, ο Άγιος Δημήτριος κοντά σε μια παραδοσιακή κρήνη, κτισμένος πάνω στα ερείπια της ομώνυμης σταυροπηγιακής μονής, η οποία πυρπολήθηκε μετά τα Ορλωφικά, ο Άγιος Σπυρίδωνας, η Αγία Παρασκευή στη Σκέμνα, οι Άγιοι Πάντες, ο Άγιος Αθανάσιος και άλλα. Υπήρχαν επίσης και άλλες εκκλησίες που σήμερα δε σώζονται παρά μόνο τα ερείπιά τους. Συνολικά αναφέρεται ότι υπήρχαν 43 εκκλησίες στη Στεμνίτσα, συμπεριλαμβανομένων των εξωκκλησίων, καθώς και των ναών που δεν σώζονται.