Το Καρνάρι ανήκει στον Δήμο Αρχανών – Αστερουσίων της Περιφερειακής Ενότητας Ηρακλείου που βρίσκεται στην Περιφέρεια Κρήτης, σύμφωνα με τη διοικητική διαίρεση της Ελλάδας όπως διαμορφώθηκε με το πρόγραμμα “Καλλικράτης”.
Η επίσημη ονομασία είναι “το Καρνάρι”. Έδρα του δήμου είναι τα Πεζά και ανήκει στο γεωγραφικό διαμέρισμα Κρήτης.
Κατά τη διοικητική διαίρεση της Ελλάδας με το σχέδιο “Καποδίστριας”, μέχρι το 2010, το Καρνάρι ανήκε στο Τοπικό Διαμέρισμα Αρχανών, του πρώην Δήμου Αρχανών του Νομού Ηρακλείου.
