Τα Κουτσογιανναίικα βρίσκονται σε υψόμετρο 750 μ. Ανήκουν στον δήμο Ναυπακτίας της Περιφερειακής Ενότητας Αιτωλοακαρνανίας που βρίσκεται στην Περιφέρεια Δυτικής Ελλάδας, σύμφωνα με τη διοικητική διαίρεση της Ελλάδας όπως διαμορφώθηκε με το πρόγραμμα “Καλλικράτης”. Έδρα του δήμου είναι η Ναύπακτος και ανήκουν στο γεωγραφικό διαμέρισμα Στερεάς Ελλάδας.
Κατά τη διοικητική διαίρεση της Ελλάδας με το σχέδιο “Καποδίστριας”, μέχρι το 2010, τα Κουτσογιανναίικα ανήκαν στο Τοπικό Διαμέρισμα Γάβρου, του πρώην Δήμου Πυλλήνης του Νομού Αιτωλοακαρνανίας.