Το κεντρικό Λιμεναρχείο Ηρακλείου στεγάζεται σε κτίριο του Λιμενικού Ταμείου μέσα στο χώρο του λιμανιού της πόλης και διοικείται από τον αντιπλοίαρχο Λ.Σ. Θεοφάνη Κούρκουλο, απόφοιτο του τμήματος Πολιτικής Επιστήμης και Δημόσιας Διοίκησης της Νομικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών,της Σχολής Εφέδρων Αξιωματικών Πεζικού, της Σχολής Ναυτικών Δοκίμων, του Σχολείου Αρχικής Εκπαίδευσης Χειριστών Αεροπλάνων ΛΣ Σχολής Ικάρων, του Σχολείου Αρχικής Εκπαίδευσης Χειριστών Ελικοπτέρων της Σχολής Αεροπορίας Στρατού, της Σχολής Ελικοπτέρων Ναυτικού, του Σχολείου Εκπαιδευτών Εδάφους ΣΠΑ/ΔΑΕ/ΓΕΑ. Έχει υπηρετήσει στο Λιμεναρχείο Σπετσών στη Διεύθυνση Λιμένων και Λιμενικών Εργων του ΥΕΝ στη Μοίρα Αεροπλάνων του ΛΣ, στη Μοίρα Ελικοπτέρων του ΛΣ καθώς και στις Διευθύνσεις Θαλασσίων Συνόρων και Εναερίων Μέσων του Αρχηγείου Λιμενικού Σώματος. Επίσης έχει διατελέσει διερευνητής και πρόεδρος της Μόνιμης Επιτροπής Διερεύνησης Αεροπορικού Ατυχήματος για τα Εναέρια Μέσα του ΛΣ καθώς και πρόεδρος του Πρωτοβάθμιου Ανακριτικού Συμβουλίου για ανθυπασπιστές, αξιωματικούς, υπαξιωματικούς ΛΣ και λιμενοφύλακες.
Σκοπός του Λιμενικού Σώματος μέσα σε αντίξοες πολλές φορές συνθήκες είναι ο σεβασμός στη θάλασσα και το θαλάσσιο περιβάλλον που αποτελεί πηγή ζωής για τη χώρα μας, πλούτου και ψυχαγωγίας και η προστασία της θάλασσας από κάθε μορφής απειλή. Στις μέρες μας, αν και υπάρχουν περιστατικά παράνομης εισόδου, με τους συνεχείς και εντατικούς ελέγχους που διεξάγονται είναι ανεπιτυχή.
Το λιμάνι της πόλης που είναι το δεύτερο μεγαλύτερο στην Ελλάδα, παρουσιάζει πολύ μεγάλη κίνηση επιβατών και οχημάτων όλο το χρόνο με καθημερινές αφίξεις και αναχωρήσεις πλοίων. Τους καλοκαιρινούς μήνες η κίνηση αυξάνεται με πολλά τουριστικά σκάφη και κρουαζιερόπλοια, καθώς επίσης και με πολλά καταπλέοντα πλοία που μεταφέρουν φορτία. Χαρακτηριστικά αναφέρομε ότι το 2012 κατέπλευσαν στο λιμάνι περίπου 2000 πλοία, με το νέο επιβατικό σταθμό του που δημιουργήθηκε τα τελευταία χρόνια, να έχει αποφέρει μόνο θετικά σχόλια και μεγάλες ευκολίες στους επισκέπτες του νησιού.
Τα συστήματα ασφαλείας που διαθέτει σήμερα το λιμάνι του Ηρακλείου, είναι από τα πιο σύγχρονα και σε συνδυασμό με την άρτια διοίκησή του, θεωρείται από τα πιο ασφαλή στην Ελλάδα.
