Ο Άγιος Αθανάσιος βρίσκεται σε υψόμετρο 210 μ. Ανήκει στον δήμο Ξηρομέρου της Περιφερειακής Ενότητας Αιτωλοακαρνανίας που βρίσκεται στην Περιφέρεια Δυτικής Ελλάδας, σύμφωνα με τη διοικητική διαίρεση της Ελλάδας όπως διαμορφώθηκε με το πρόγραμμα “Καλλικράτης”. Έδρα του δήμου είναι ο Αστακός και ανήκει στο γεωγραφικό διαμέρισμα Στερεάς Ελλάδας.
Κατά τη διοικητική διαίρεση της Ελλάδας με το σχέδιο “Καποδίστριας”, μέχρι το 2010, ο Άγιος Αθανάσιος ανήκε στο Τοπικό Διαμέρισμα Αρχοντοχωρίου, του πρώην Δήμου Αλυζίας του Νομού Αιτωλοακαρνανίας.